Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Speer4cG3UXD1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms