Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4931429L15RikE9PVU2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4931429L15RikE9PVU2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms