Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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