Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms