Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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