Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms