Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms