Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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