Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Syndig1A2ANU3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms