Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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