Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn8Q9Z260 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn8Q9Z260 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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