Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms