Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M1

Xcr1, Chemokine XC receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcr1Q9R0M1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xcr1Q9R0M1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xcr1Q9R0M1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2476.6 ms