Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tcf23Q9JLR5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tcf23Q9JLR5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms