Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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