Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim54Q9ERP3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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