Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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