Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn22Q9D7U6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Cldn22Q9D7U6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cldn22Q9D7U6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms