Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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