Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Chmp4cQ9D7F7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Chmp4cQ9D7F7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Chmp4cQ9D7F7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Chmp4cQ9D7F7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Chmp4cQ9D7F7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4cQ9D7F7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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