Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cldn23Q9D7D7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cldn23Q9D7D7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cldn23Q9D7D7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cldn23Q9D7D7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cldn23Q9D7D7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cldn23Q9D7D7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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