Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al3Q9D4U4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms