Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem88Q9D0N8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms