Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms