Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ssbp3Q9D032 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ssbp3Q9D032 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ssbp3Q9D032 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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