Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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