Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shmt2Q9CZN7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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