Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CYI0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms