Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Cnih4Q9CX13 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnih4Q9CX13 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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