Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkrip1Q9CWV6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms