Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc3Q9CWU5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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