Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9CWU4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms