Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms