Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup155Q99P88 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms