Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms