Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms