Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TardbpQ921F2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TardbpQ921F2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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