Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms