Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cacng8Q8VHW2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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