Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms