Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms