Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms