Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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