Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf628Q8CJ78 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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