Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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