Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms