Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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