Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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