Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm20747-202ENSMUST00000187856 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim35Q8C006 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim35Q8C006 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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