Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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